Positiv c- eller p-ANCA uten påvist anti-PR3 eller anti-MPO utelukker ikke de sykdommer som nedenfor er anført assosiert med henholdsvis anti-PR3 og anti-MPO. Men resultatet av anti-PR3 og anti-MPO bør i vaskulitt-sammenheng tillegges større betydning enn resultatet av ANCA. Anti-PR3 regnes som meget spesifikt for Wegeners granulomatose. Anti-MPO ses først og fremst ved pauci-immune rapidly progressive ("crescentic") glomerulonephritis (RPGN), Churg-Strauss" syndrom og mikroskopisk polyangitt (MPA), men også hos et fåtall pasienter med Wegeners granulomatose og ved andre sjeldne tilstander. Eventuell betydning av ANCA med andre spesifisiteter enn anti-PR3 og anti-MPO, for eksempel anti-elastase, anti-katepsin G, anti-laktoferrin, anti-a-enolase og anti-BPI (bactericidal permeability increasing protein) er stort sett usikker.