Ved IBD av usikker undertype (”indeterminate colitis”) taler positiv ASCA for utvikling til en Crohns sykdom, især dersom antistoff mot nøytrofilt cytoplasa-antigen (ANCA) er negativ. Likeledes taler en positiv ANCA (positiv p-ANCA med negativ anti-MPO) for ulcerøs kolitt, og i sær dersom ASCA er negativ. ASCA er verken egnet som diagnostisk test for IBD eller som oppfølgingstest for løpende vurdering av sykdomsaktivitet ved IBD/Crohn.