Det er vanskelig å angi hvilken risiko for arteriosklerotisk hjerte-karsykdom som svarer til gitte verdier av apolipoprotein A-1. Men personer med s-apolipoprotein A-1 svarende til 10-persentilen i befolkningen har ca. 3 ganger så stor risiko som personer med konsentrasjon svarende til 90-persentilen. Ved risikovurdering må det taes hensyn til andre risikofaktorer, så som røyking, høyt blodtrykk, inaktivitet, alder, kjønn, arvelig belastning og diabetes mellitus. Disse faktorene påvirker imidlertid også s-apoA1. Når overvekt og røyking reduserer apoA1 vil man statistisk forsøke å korrigere for dette som en konfunderende faktor, men sett i lys av nyere studier der medikamenter som øker apoA1 har vært benyttet er det usikkert om slike statistiske korrigeringer er i stand til å gi et tilstrekkelig nyansert og riktig bilde.
Høye verdier av s-apolipoprotein A-1 kan sees ved behandling med østrogener, antiepileptika eller beta-2-stimulerende (bronkodilaterende) midler, ved regelmessig moderat alkoholinntak, og dessuten ved to sjeldne, arvelige tilstander: Familiær hyper-alfa-lipoproteinemi, der HDL-partiklene er normale og individets livslengde er økt; og hyper-alfa-triglyceridemi, der HDL-partiklene har kraftig økt triglyceridinnhold, og individets forventede livslengde er normal. Et høyt inntak av fett, unntatt transfett, vil også øke s-ApoA1.
Lave verdier er assosiert med bl.a. overvekt, hypertriglyceridemi, mangel på mosjon, røyking, bruk av noen beta-blokkere og tiazidbruk. Lave verdier kan dessuten være forårsaket av sykdommer, som diabetes mellitus, lever- og nyresvikt, hypo- og hypertyreoidisme og inflammasjoner (særlig enkelte infeksjoner). Lave verdier sees også ved noen sjeldne, arvelige tilstander: Familiær hypo-alfa-lipoproteinemi, Tangiers sykdom, som skyldes mangel av et transportprotein for kolesterol i cellemembranen (ABC1A), og ved mangel på enzymet lecitin:kolesterolacyltransferase (LCAT).